Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26c1B2RXA7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26c1B2RXA7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms