Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Siah3B2RWG3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms