Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc22a28B2RT89 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms