Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2012B1B0R1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm2012B1B0R1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2012B1B0R1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2012B1B0R1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2012B1B0R1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms