Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn7aB1AYL1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn7aB1AYL1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn7aB1AYL1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms