Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms