Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930402K13RikB1AW18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930402K13RikB1AW18 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms