Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtpruB1AUH1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms