Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grik3B1AS29 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grik3B1AS29 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms