Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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PtprsB0V2N1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PtprsB0V2N1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PtprsB0V2N1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PtprsB0V2N1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PtprsB0V2N1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PtprsB0V2N1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprsB0V2N1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprsB0V2N1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms