Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-M5A7VMS3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M5A7VMS3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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