Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pm20d2A3KG59 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pm20d2A3KG59 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pm20d2A3KG59 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms