Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm6880A3KG45 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm6880A3KG45 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms