Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htra4A2RT60 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htra4A2RT60 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms