Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms