Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pramef17A2ASJ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pramef17A2ASJ1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms