Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef25A2ASI9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms