Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scn3aA2ASI5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scn3aA2ASI5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms