Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga8A2ARA8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga8A2ARA8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms