Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtcflA2APF3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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