Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll9A2APC3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll9A2APC3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms