Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc183A2AJB1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc183A2AJB1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms