Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec16aA2AIX1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec16aA2AIX1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms