Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhbdl2A2AGA4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms