Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2dnl2A2AFH2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms