Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calcoco2A2A6M5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Calcoco2A2A6M5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms