Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam71e1A1L3C1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms