Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms