Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0U1RNP2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RNP2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms