Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU7

Ighv1-82, Immunoglobulin heavy variable 1-82 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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