Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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