Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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