Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv2A0A0B4J1G8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trbv2A0A0B4J1G8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trbv2A0A0B4J1G8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trbv2A0A0B4J1G8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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