Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28360A0A087WR25 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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