Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W1

Ighv1-50, Immunoglobulin heavy variable 1-50 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-50A0A075B5W1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ighv1-50A0A075B5W1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv1-50A0A075B5W1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv1-50A0A075B5W1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv1-50A0A075B5W1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ighv1-50A0A075B5W1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ighv1-50A0A075B5W1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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