Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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