Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Trim12aQ99PQ1 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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