Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Hoxd10P28359 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms