Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms