Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Casq1O09165 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms