Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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