Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim39Q9ESN2 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Trim39Q9ESN2 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Trim39Q9ESN2 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Trim39Q9ESN2 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Trim39Q9ESN2 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Trim39Q9ESN2 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim39Q9ESN2 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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