Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Sox12Q04890 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms