Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms