Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gtpbp6Q3U6U5 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms