Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Traf3ip1Q149C2 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms