Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms