Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hoxd9P28357 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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