Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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