Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtpreP49446 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtpreP49446 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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